Il romanzo, che fa parte del cosiddetto ciclo indo-malese di Salgari, pone qualche problema all'atto di identificarne la sua precisa posizione nel ciclo stesso: la saga salgariana, infatti, non è frutto di un lavoro organico, né impostato a tavolino, ma di intuizioni e contaminazioni spesso estemporanee, condotte talvolta in maniera addirittura confusa dal novelliere veneto. È possibile, tuttavia, trovare una mediazione attraverso alcuni dati di massima. I misteri della jungla nera è senz'altro il primo romanzo del ciclo se si tiene in considerazione la data della sua pubblicazione in volume dall'editore genovese Antonio Donath: il 1895. È, al contrario, il secondo romanzo del ciclo, se si considerano una serie di altri aspetti. I misteri della jungla nera era apparso per la prima volta ai princìpi del 1887 in appendice al quotidiano Il Telegrafo di Livorno, sotto il titolo de Gli strangolatori del Gange.